Page 50 - SaxoCell Jahresbericht 22/23
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OMICS
Die Aufgabe von SaxoCellOMICS besteht darin, eine gemeinsame Plattform bereitzustellen, die
modernste zelluläre und molekulare Messtechniken, Datenverarbeitung sowie -interpretation
umfasst. Diese Plattform soll die Entwicklung und Herstellung von Gen- und Zelltherapeutika
unterstützen, indem sie effiziente Verfahren für die Überwachung von Therapien, die
Identifizierung von Wirkmechanismen und neuen Targets sowie die Entwicklung von
Qualitätskriterien für die Herstellung und die Entwicklung prädiktiver Biomarker bereitstellt. Durch
die enge Zusammenarbeit mit anderen SaxoCell-Partnern trägt SaxoCellOMICS zur Stärkung der
Wettbewerbsfähigkeit der Unternehmen in der SaxoCell-Region bei.
Projektleitung: Kristin Reiche & Ezio Bonifacio
Partner: Fraunhofer IZI, Technische Universität Dresden, Universität Leipzig, ecSeq GmbH
Im Jahr 2022/23 wurde eine umfassende Liste relevanter Methoden und Technologien erstellt und
allen SaxoCell-Partnern über die Website im Mitgliederbereich zur Verfügung gestellt. Dieser
Prozess wurde in Zusammenarbeit mit den SaxoCellOMICS-Partnern und dem SaxoCellHub
durchgeführt.
Darüber hinaus wurden Empfehlungen und Standardarbeitsanweisungen (SOPs) für die
Probenentnahme und -verarbeitung entwickelt und harmonisiert. Bestehende Arbeitsabläufe wie
Durchflusszytometrie und Transkriptom-Sequenzierung wurden als Vorlagen verwendet. Die
Harmonisierung wird zwischen den Produktionsstätten TUD und IZI in Zusammenarbeit mit
SaxoCellCLINICS durchgeführt. Darüber hinaus werden SOPs und Richtlinien für die
Datengenerierung und -analyse ausgewählter Assays entwickelt.
Ein weiterer wichtiger Schritt war die Erstellung einer Beschreibung der verfügbaren
experimentellen Arbeitsabläufe und Analysetypen sowie einer Kostenmatrix. Diese Matrix wird die
Beratung und Kostenkalkulation für SaxoCell-Projekte ermöglichen.
Ein Schwerpunkt des Projekts ist die Koordinierung und Harmonisierung der an den verschiedenen
Standorten verfügbaren Methoden, z. B. Durchflusszytometrie (FACS) oder RNAseq, durch die
Durchführung von Laborvergleichen zwischen den SaxoCellOMICS-Partnern, um die
Übereinstimmung der Messungen zwischen den Standorten zu ermitteln und gegebenenfalls zu
verbessern. Die Planung für diese Ringversuche hat bereits begonnen, und es wurden Proben
identifiziert und Methoden für die Probenverarbeitung festgelegt. 45
